基础医学是医学科学的基石，聚焦于探索人体生命活动规律、疾病发生机制及防治策略的核心学科。皖南医学院基础医学是学校建立最早的学科之一，1981年开始招收硕士研究生，2010年获批基础医学一级学科硕士点，2022年获批安徽省应用型高峰培育学科，2024年获批安徽省首批“双特色”学科。基础医学本科专业依托学校高水平学科平台和优质师资团队，秉持“厚基础、强能力、重创新”的人才培养理念，实施本科生导师制和早团队、早实验、早选题的“三早”科研育人模式，为本科生升学就业提供系统的学术、科研能力训练，培养具有创新思维、科研潜力、全面发展的卓越医学人才。

学制、学位与学费:学制五年，授予医学学士学位;5200元/生.学年。

就业去向:主要去向包括继续在医学领域深造，或在高校、医院、科研院所和生物医药企业从事医学教育与研发工作，以及卫生事业单位从事医学卫生管理工作。