皖南医学院电镜中心占地面积约150平方米，总投入约1500万元，现有透射电子显微镜和台式扫描电子显微镜2种应用最广泛的电子显微镜，其中透射电镜最高放大倍数可达到60万倍，分辨率达到0.2nm，同时还具备冷冻样品观察及能谱分析功能。

电镜中心还拥有研究型冷冻超薄切片机、全自动组织处理机、制刀机、正置显微镜、体视显微镜、纯水仪、离子溅射镀膜仪等最全的电镜生物制样设备。可承担超薄切片制样、冷冻制样、负染色等样本制作技术，能为生物学、医学、药学、化学等学科提供检测分析工作与研究。是一个集教学科学研究和对外服务于一体的综合性研究中心。

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透射电子显微镜和台式扫描电子显微镜