基础医学一级学科始建于1958年，于1981年首次招收培养硕士研究生，至今已毕业硕士研究生数百人，为我校乃至国家医药卫生事业的发展做出了巨大贡献。

学科于2010年获批基础医学一级学科硕士授权点，凝练有人体解剖与组织胚胎学、免疫学、病原生物学、病理学与病理生理学及法医学5个二级学科研究方向。近年来，学科秉承传统研究技术与平台优势，在粉螨生物学及转化应用、蛇毒活性成分的研发等方面研究成果丰硕，形成了特色研究方向并在学术领域产生重大影响。法医病理、法医毒理学与毒物分析及法医物证是法医学方向的重要研究内容，在国家级特色专业和一流专业建设引领下，其研究生培养与社会服务作用凸显，已产生广泛的社会影响力。

目前，学科正以建设安徽省应用型高峰培育学科为契机，多措并举激发青年教师科研活力，积极组建科研创新团队。学科团队现有145人，其中教授及研究员19人、副高职称58人，博士46人，获批省级教学团队5个、省名师工作室2个、省最美科技工作者1人、省“特支计划”1人、入选省教育厅科研创新团队1个。五年来，本学科点获批国家自然科学基金项目9项、省部级科研项目50余项，发表论文近400余篇。先后获得安徽省教学成果一等奖4项、安徽省科技成果三等奖以上共3项。学科新建有芜湖市螨类检验与防控工程技术研究中心、基础医学科研共享平台及肿瘤表观遗传研究室等，科研设备总价值9000余万元。